[坎贝尔生物学 第490页练习题] 二本鎖DNAにおいて、次の配列のうち制限酵素の切断部位として認識される可能性が最も高いのはどれですか？

二本鎖DNAにおいて、次の配列のうち制限酵素の切断部位として認識される可能性が最も高いのはどれですか？

  • A: 5'-AAGG-3' 3'-TTCC-5'
  • B: 5'-GGCC-3' 3'-CCGG-5'
  • C: 5'-ACCA-3' 3'-TGGT-5'
  • D: 5'-AAAA-3' 3'-TTTT-5'

Explanation

制限酵素は特定のDNA配列を認識し、そのほとんどがパリンドローム配列です。パリンドローム配列とは、一方の鎖（5'から3'方向）で順方向に読むのと、相補鎖（これも5'から3'方向）で逆方向に読むのが同じになる配列のことです。選択肢Bの場合、上側の鎖で5'-GGCC-3'と読み、下側の鎖で5'-GGCC-3'（3'-CCGG-5'を右から左に読む）と読むことで、それがパリンドロームであることが確認されます。