[Campbell Biology P.400] Der Text behandelt sowohl Konsensussequenzen als auch Sequenzlogos.... | Practice Question

Der Text behandelt sowohl Konsensussequenzen als auch Sequenzlogos. Welche entscheidenden Informationen, die ein Sequenzlogo liefert, gehen typischerweise verloren, wenn nur eine Konsensussequenz verwendet wird?

  • A: Die absolute Anzahl der analysierten Sequenzen.
  • B: Die spezifische Nukleotidsequenz.
  • C: Die relativen Häufigkeiten aller Basen an einer bestimmten Position und die Gesamtvorhersagbarkeit dieser Position.
  • D: Das Vorhandensein von Mutationen.

Explanation

Eine Konsensussequenz liefert nur die häufigste Base an jeder Position und einen Bindestrich, wenn keine klare Mehrheit vorhanden ist , wodurch Informationen über die relativen Anteile anderer Basen und die 'Stärke' des Konsensus verloren gehen. Ein Sequenzlogo hingegen verwendet die Buchstabenhöhe, um relative Häufigkeiten darzustellen, und die Stapelhöhe, um die Gesamtvorhersagbarkeit/den Informationsgehalt zu zeigen, was eine viel reichere Ansicht von Konservierung und Variation bietet.